Ο Ναυτικός Όμιλος Σαντορίνης με την παρουσία και τις δράσεις του, προσπαθεί να μεταδώσει στα παιδιά και τους νέους τις αξίες του θαλάσσιου πολιτισμού και της ναυτοσύνης, προκειμένου να αναπτύξει ο σύγχρονος άνθρωπος αισθήματα αγάπης για τη Θάλασσα. Βρίσκεται εδώ για να διασώσει τις Ναυτικές Παραδόσεις της χώρας και να αποκτήσουν τα παιδιά μας σωστή Ναυτική Παιδεία.
Η ιστορία της Σαντορίνης πάντοτε ήταν και είναι άρρηκτα δεμένη με τη θάλασσα. Οι άνθρωποι της Σαντορίνης του τότε, χρησιμοποιούσαν τη θάλασσα ως μέσο μεταφορών για τις εμπορικές τους δραστηριότητες αλλά και προστασίας από εχθρούς (πειρατεία, κατακτητές).
Οι άνθρωποι της Σαντορίνης τού σήμερα, η νέα γενιά, τα παιδιά μας, μένουν στον τόπο τους και χρησιμοποιούν αυτή τη μαγική θάλασσα που περιβάλλει το νησί για να προσελκύσουν όλους τους λαούς της γης.
Το λογότυπό του Ναυτικού Ομίλου Σαντορίνης, αποτυπώνει τον τιμονιέρη που “καπετανεύει” με μαεστρία το πλοίο του, στην τοιχογραφία των ανασκαφών της Προϊστορικής Πόλης του Ακρωτηρίου της Σαντορίνης! Αυτό αποδεικνύει και τους άρρηκτους δεσμούς που συνδέουν τον τόπο και αυτό που κάνουμε, με το παρόν και το παρελθόν μας.